Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scn9aQ62205 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scn9aQ62205 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scn9aQ62205 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scn9aQ62205 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scn9aQ62205 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scn9aQ62205 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scn9aQ62205 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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