Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vsx2Q61412 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms