Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms