Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd1Q61345 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd1Q61345 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd1Q61345 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd1Q61345 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Foxd1Q61345 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms