Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms