Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms