Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms