Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms