Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms