Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms