Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp18Q5SSI6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms