Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim58Q5NCC9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms