Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Xirp2Q4U4S6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms