Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Syne3Q4FZC9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Syne3Q4FZC9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Syne3Q4FZC9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Syne3Q4FZC9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Syne3Q4FZC9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Syne3Q4FZC9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Syne3Q4FZC9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Syne3Q4FZC9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Syne3Q4FZC9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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