Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shank3Q4ACU6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms