Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxn3Q499D0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxn3Q499D0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms