Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms