Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms