Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prdm6Q3UZD5 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms