Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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H2-Eb2Q3UUV9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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H2-Eb2Q3UUV9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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H2-Eb2Q3UUV9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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H2-Eb2Q3UUV9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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H2-Eb2Q3UUV9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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H2-Eb2Q3UUV9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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H2-Eb2Q3UUV9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb2Q3UUV9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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