Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms