Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Nkx6-3Q3UHX8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nkx6-3Q3UHX8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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