Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm5113Q3UGK8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm5113Q3UGK8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm5113Q3UGK8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm5113Q3UGK8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm5113Q3UGK8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm5113Q3UGK8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5113Q3UGK8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm5113Q3UGK8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm5113Q3UGK8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Gm5113Q3UGK8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5113Q3UGK8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms