Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms