Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms