Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hvcn1Q3U2S8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hvcn1Q3U2S8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms