Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Q3U1D9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Q3U1D9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Q3U1D9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Q3U1D9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Q3U1D9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Q3U1D9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Q3U1D9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Q3U1D9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Q3U1D9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U1D9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U1D9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U1D9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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