Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms