Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms