Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc9Q3U0M1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms