Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ctdnep1Q3TP92 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ctdnep1Q3TP92 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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