Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prr27Q3SYJ2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms