Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Treml4Q3LRV9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms