Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Fam178bQ24JP3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Fam178bQ24JP3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Fam178bQ24JP3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Fam178bQ24JP3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Fam178bQ24JP3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Fam178bQ24JP3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Fam178bQ24JP3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Fam178bQ24JP3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms