Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cd300lgQ1ERP8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms