Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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