Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Traf3ip1Q149C2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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