Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd12Q0VE29 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms