Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem52bQ0VBF2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms