Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms