Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf541Q0GGX2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms