Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc4Q08624 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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