Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms