Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Calb2Q08331 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Calb2Q08331 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms