Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms