Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prrx2Q06348 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms