Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms