Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms