Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms