Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mmp11Q02853 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Mmp11Q02853 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Mmp11Q02853 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Mmp11Q02853 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Mmp11Q02853 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Mmp11Q02853 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Mmp11Q02853 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Mmp11Q02853 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Mmp11Q02853 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Mmp11Q02853 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Mmp11Q02853 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Mmp11Q02853 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Mmp11Q02853 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Mmp11Q02853 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Mmp11Q02853 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Mmp11Q02853 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143 ms